Biología

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Pasantía en Astrolab Biotecnología. Contribuciones al análisis de microbiota intestinal y su aplicación en nutrición de precisión
(Universidad CES, 2025-11-10) Rojas Correa, Daniela; Asesor
La caracterización de la microbiota intestinal es hoy una pieza clave en la nutrición de precisión, ya que permite diseñar estrategias dietarias personalizadas basadas en evidencia científica. En este contexto, la pasantía realizada en Astrolab Biotecnología tuvo como objetivo fortalecer el vínculo entre la investigación en microbiota y su aplicación práctica en salud. Durante el proceso, se actualizaron bases de datos de funcionalidad microbiana con información adaptada al contexto colombiano, se reestructuró un dashboard nutricional que integra variables dietarias locales y se desarrolló un pipeline bioinformático de metagenómica tipo shotgun, con el fin de optimizar la identificación taxonómica y funcional de las comunidades microbianas. Adicionalmente, se evaluó la viabilidad microbiológica de un suplemento probiótico mediante métodos cuantitativos complementarios, verificando la concentración de bacterias viables y su conformidad con los estándares regulatorios. Los resultados obtenidos aportan al desarrollo de herramientas analíticas, de comunicación científica que respaldan la validez técnica de los análisis de microbiota, así como el diseño y desarrollo de mejores alimentos, y contribuyen a una comprensión más informada de la relación entre alimentación y salud intestinal en la población colombiana.
Pasantía en la Universidad EAFIT. Integración de herramientas biotecnológicas en investigación aplicada hacia la bioeconomía y la sostenibilidad
(Universidad CES, 2025-11-08) García Ortega, Sofía; Asesor; Asesor
Durante la pasantía desarrollada en Vitra Biotecnología y en el Laboratorio de Biotecnología Vegetal de la Universidad EAFIT se implementaron herramientas de biología molecular y cultivo in vitro en distintos proyectos orientados a la investigación aplicada y al desarrollo biotecnológico. Las actividades incluyeron la transformación genética de Saccharomyces cerevisiae para la producción de psilocibina, el análisis de genes transportadores de cadmio en diferentes variedades de cacao (Theobroma cacao L.), el cultivo in vitro de cebolla larga (Allium fistulosum L.), y la búsqueda bibliográfica sobre péptidos bioactivos con potencial aplicación en salud y cosmética. Los resultados destacaron la importancia del cumplimiento estricto de los protocolos experimentales para garantizar la eficiencia en los procesos de transformación genética; evidenciaron variaciones entre variedades de cacao en los genes asociados al transporte de cadmio; y subrayan la necesidad de mantener condiciones rigurosas de asepsia y control microbiológico durante el establecimiento in vitro de cebolla larga, como requisito esencial para prevenir la contaminación y asegurar la viabilidad del material vegetal. Asimismo, el análisis bibliográfico permitió reconocer que la producción heteróloga de péptidos dependerá de la capacidad técnica y los recursos disponibles, lo que orienta futuras estrategias de investigación y desarrollo dentro de Vitra. En conjunto, la experiencia contribuyó al fortalecimiento de competencias técnicas, analíticas y colaborativas, reafirmando el valor de la biotecnología como disciplina estratégica para la innovación científica y la generación de soluciones sostenibles en el ámbito productivo. Asimismo, el trabajo desarrollado permitió aportar directamente al posicionamiento de Vitra Biotecnología como un centro de desarrollo biotecnológico aplicado, al consolidar procesos experimentales, metodológicos y de investigación que amplían su portafolio tecnológico y fortalecen su proyección como empresa emergente del sector.
Estimación de rangos de hogar y adquisición de experiencia en recolección de datos de delfines. Una pasantía en Archipelagos Institute of Marine Conservation – Samos, Grecia
(Universidad CES, 2025-11-07) García Castaño, Felipe; Asesor; Asesor
Entre el 16 de febrero y el 16 de mayo de 2025, realicé mi pasantía en Archipelagos Institute of Marine Conservation, como alternativa a la modalidad de tesis de mi carrera en biología. El objetivo principal fue adquirir experiencia real en el estudio de mamíferos marinos, específicamente cetáceos, desarrollando habilidades esenciales para mi futuro profesional. Durante la pasantía participé en salidas al mar para la recolección de datos sobre comportamiento, bioacústica, ecolocación, tráfico marítimo y contaminación, aplicando metodologías como foto-identificación con datos geoespaciales. Paralelamente, asistí a cursos técnicos sobre programas de análisis bioestadísticos, geoespaciales y respuesta a varamientos. Mi proyecto principal consistió en estimar el rango de hogar (home range) de individuos de delfines nariz de botella (Tursiops truncatus), identificados en la base de datos del instituto. Para ello, realicé la depuración y análisis de registros fotográficos y geográficos, generando una tabla con los rangos espaciales por individuo, útil como base para futuras investigaciones. Adicionalmente, colaboré en la curación y mejora de las bases de datos de cetáceos. Esta experiencia me permitió confirmar mi vocación profesional, fortalecer competencias en investigación aplicada y comprender la importancia del trabajo científico riguroso en la conservación de cetáceos.
Experiencia formativa en Investigación Científica y Vigilancia Epidemiológica a partir de Biología Molecular, Cultivos Celulares y Genómica: Pasantía en el Laboratorio Genómico One Health - Universidad Nacional de Colombia.
(2025-11-07) Mieles Múnera, Maria Fernanda; Asesor
El Laboratorio Genómico One Health (LGOH) es un centro de investigación multidisciplinaria enfocado en la integración de la salud humana, animal y ambiental bajo el concepto de “Una Sola Salud”. El LGOH lleva proyectos direccionados hacia la epidemiología y la salud pública, principalmente enfocados en el estudio de la Enfermedad Febril Aguda Indiferenciada (EFAI) y cáncer; proyectos en los cuales se me permitió participar realizando como apoyo en procedimientos de las áreas de Biología Molecular, Genómica, Metagenómica, Cultivos Celulares e Inmunología. Adicionalmente, ejecuté un Plan Operativo Estándar (POE) para la recolección y análisis de muestras, para proyectos de Epidemiología Basada en Aguas Residuales (EBD); para este POE realicé un ensayo por Biología Molecular para la comparación de dos métodos de extracción de ácidos nucleicos a partir de muestras de agua provenientes de Leticia, el objetivo principal de este experimento era la detección del Virus del Moteado Suave del Pimiento (PMMoV), un importante indicador de materia fecal humana. La pasantía en el LGOH me permitió desarrollar y fortalecer competencias técnicas y analíticas, contribuyendo al desarrollo de habilidades profesionales y a la comprensión de la importancia de la investigación científica en la salud.
Pasantía en el Laboratorio Genómico One Health , Universidad Nacional de Colombia. fortalecimiento de competencias en biología celular y molecular aplicadas al estudio de patógenos emergentes
(Universidad CES, 2025-11-07) Pardo López , Luisa Fernanda; Asesor
La pasantía se desarrolló en el Laboratorio Genómico One Health de la Universidad Nacional de Colombia, con el propósito de fortalecer la formación en biología celular y molecular mediante la práctica de técnicas experimentales y la planeación científica aplicada a proyectos de investigación biomédica. Este laboratorio orienta sus investigaciones al estudio de patógenos de importancia en salud pública bajo el enfoque One Health, integrando metodologías moleculares, celulares, bioinformáticas y epidemiológicas. Las actividades comprendieron el mantenimiento de líneas celulares C6/36 y VERO, la implementación de técnicas de biología molecular e inmunología (PCR convencional y en tiempo real, inmunoensayos tipo ELISA y secuenciación de nueva generación) y el diseño de un procedimiento operativo estándar (POE) para el aislamiento y diferenciación de monocitos a macrófagos, optimizando condiciones con suero autólogo y lavado con PBS. Este protocolo permitió obtener una diferenciación espontánea efectiva, evidenciada por cambios morfológicos característicos y alta viabilidad celular sin el uso de factores exógenos. Estas experiencias fortalecieron competencias técnicas, analíticas y de planeación experimental, promoviendo el pensamiento crítico y el manejo responsable de metodologías avanzadas. En conjunto, la pasantía permitió integrar la biología celular, molecular e inmunológica con la genómica y la bioinformática, contribuyendo a la comprensión interdisciplinaria de las enfermedades infecciosas y a la consolidación de una formación científica sólida en el marco de la investigación biomédica y del enfoque One Health.
Formación práctica en genética forense. Aplicando metodologías moleculares en casos reales de parentesco en el Laboratorio Genes SAS
(Universidad CES, 2025-11-07) Palacio Pineda, Mariana; Asesor; Asesor
La pasantía se realizó en el laboratorio Genes S.A.S, especializado en pruebas de identificación y parentesco, con el objetivo de fortalecer competencias prácticas en biología molecular. Durante el período de práctica, se participó activamente en el flujo de trabajo del laboratorio, que incluyó la preparación de muestras biológicas, la extracción de ADN mediante el método de Chelex-100, la amplificación por PCR multiplex de marcadores STR autosómicos y electroforesis capilar usando el equipo ABI 3500. Adicionalmente, se realizó la interpretación de electroferogramas con el software GeneMapper™ y el análisis de casos complejos de filiación usando el programa Familias 3. Se procesaron exitosamente 1,126 muestras de cito cepillos y se completó la extracción de ADN en 114 de ellas. Se analizaron 105 electroferogramas y 27 casos de filiación compleja. Esta pasantía permitió la aplicación integral de los conocimientos teóricos, consolidando las competencias técnicas y analíticas necesarias para la genética forense. Además, la experiencia demostró que la confiabilidad de los resultados depende de la integración rigurosa de un flujo de trabajo estandarizado, sustentado en principios científicos y en un sistema de gestión de la calidad.
Contribución a la generación de información sobre la biodiversidad marina almacenada en colecciones biológicas
(2025-10-31) Álvarez Vargas, Juanita; Asesor
Durante la pasantía realizada en el Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras (INVEMAR), se apoyaron diversas actividades del Museo de Historia Natural Marina de Colombia (MHNMC), enfocadas en el fortalecimiento de las colecciones biológicas y la generación de conocimiento sobre la biodiversidad marina. Las actividades incluyeron la curaduría de más de 200 lotes de muestras biológicas, extracción de tejido y ADN de 163 individuos de crustáceos, así como la implementación de técnicas de biología molecular como PCR y electroforesis. Se realizaron 103 ensayos de PCR utilizando diferentes combinaciones de primers y polimerasas, de los cuales 41 resultaron positivos. También se participó en actividades de capacitación en herramientas de bioinformática y manejo de datos, así como en eventos de divulgación científica. Esta experiencia permitió desarrollar habilidades prácticas en genética y taxonomía, contribuyendo a estudios sobre la diversidad marina del Caribe y Pacífico colombiano.
Reporte de una serie de casos de tremores en individuos Oophaga lehmanni (Anura Dendrobatidae) pertenecientes a un programa de conservación en la Fundación Zoológica de Cali
(Universidad CES, 2025-10-31) Torres Daza, Victoria; Peña Stadlin, Juliana Esmeralda; Pérez García, Janeth
Oophaga lehmanni, especie críticamente amenazada y endémica del suroccidente colombiano, es mantenida en la Fundación Zoológica de Cali como parte de un programa ex situ de conservación. Entre 2020 y 2024, se documentaron 17 casos en juveniles con un síndrome clínico caracterizado por tremores generalizados, acompañados de debilidad, pérdida de peso y deterioro progresivo de la condición corporal. Se definió un perfil clínico y se aplicaron diversos protocolos terapéuticos para evaluar su eficacia y explorar posibles causas subyacentes. Los tratamientos incluyeron gluconato de calcio, cloruro de magnesio, multi vitamínicos biorreguladores y cannabinoides, administrados por vía tópica o nebulizada. A pesar de la diversidad de tratamientos, solo un individuo presentó recuperación completa. La tasa de letalidad fue del 94 %. Estudios histopatológicos en individuos fallecidos revelaron signos compatibles con enfermedad metabólica ósea, incluyendo mineralización deficiente, osteoide inmaduro, hiperplasia osteoblástica y ausencia de cristales en sacos endolinfáticos. También se identificaron lesiones hepáticas, dérmicas y gastrointestinales asociadas a procesos degenerativos y carenciales. El análisis retrospectivo de condiciones de manejo evidenció deficiencias en la exposición a radiación UVB hasta 2023 y posibles limitaciones en la biodisponibilidad de algunos nutrientes Estos hallazgos sugieren una etiología multifactorial. Se recomienda la implementación de protocolos preventivos que incluyan control estricto de iluminación, suplementación nutricional funcional, monitoreo fisiológico y diagnóstico temprano. Se propone además el uso de radiografía dental digital como herramienta no invasiva para evaluar salud ósea en anuros pequeños y aportar así a la sostenibilidad de los programas de conservación ex situ para especies críticamente amenazadas.
Interacciones florales en el neotrópico: de los datos a la publicación abierta de información interoperable
(Universidad CES, 2025-06-19) Pineda Zuluaga, Tomás; Cardona Duque, Juliana
La historia natural se encarga de la observación y el registro del mundo natural. La preservación de la información sobre historia natural es fundamental para comprender la dinámica actual y pasada del mundo natural. Gracias a esto, es posible comparar las características del mundo natural y sus cambios a través del tiempo y el espacio. Esta información es decisiva para investigadores y tomadores de decisiones en la labor de mitigar la pérdida de biodiversidad que acompaña a la crisis climática actual. Las colecciones de historia natural son responsables de preservar la información sobre historia natural durante el mayor tiempo posible; sin embargo, esta información es de poca utilidad si no está abiertamente disponible para el público. A nivel mundial, existe un llamado urgente para proteger a los organismos polinizadores mediante la incorporación de esta necesidad en las agendas nacionales. Sin embargo, para la región Neotropical no existe un centro de datos que contenga información sobre polinizadores verdaderamente efectivos y que reconozca claramente su papel (más allá de los meros visitantes florales), incluyendo sus plantas asociadas. Este proyecto busca generar un catálogo de polinizadores efectivos para el Neotrópico y crear un centro de datos sobre interacciones florales, mediante el lenguaje de programación Python, estableciéndose en un servidor temporal, cuya información estará disponible públicamente. Para este objetivo, se realizó inicialmente una búsqueda bibliográfica sobre estudios de polinización en el Neotrópico en los últimos 70 años. Se encontraron y catalogaron 765 registros de 61 artículos científicos (MS2), la mayoría centrados en palmas (casi el 30%). Estos registros se agregaron a la base de datos "Polinización de la Región Neotropical" generada por Vélez-Viana y Cardona-Duque (2021), y los campos se estandarizaron según el estándar Darwin Core (DwC) y algunos campos de REBIPP (2025). Se diseñó un diseño gráfico dirigido al público científico y general para establecer la distribución espacial de la información en la página web. El centro de datos de interacciones florales estará disponible públicamente a través de la Universidad CES.
Propagación de portainjertos clonales, fortalecimiento en detección de patógenos y evaluación de la resistencia a Phytophtora cinnamomi en el cultivo del aguacate (Persea americana Mill)
(Universidad CES, 2025-06-19) Daniela, Ortiz Quintero; Asesor; Asesor
Este informe presenta los resultados de una pasantía realizada en AGROSAVIA, enfocada en la producción de portainjertos clonales de aguacate, con énfasis en el proceso de enraizamiento, diagnóstico fitosanitario y evaluación agronómica. Se logró un 98% de eficiencia en el enraizamiento utilizando técnicas de etiolación y aplicación de ácido indol-butírico. Además, se evaluaron 398 árboles de aguacate ‘Hass’ para seleccionar genotipos con alto rendimiento y sanidad. Un bioensayo en invernadero reveló que el 40% de las variedades evaluadas presentaron resistencia a Phytophthora cinnamomi. En campo, se identificaron plagas clave (trips y araña roja), mientras que los análisis de laboratorio detectaron fitopatógenos como Fusarium. No se encontró presencia de P. cinnamomi en las muestras de campo. Los resultados fortalecen la estrategia de producción de materiales resistentes y promueven la implementación de prácticas diagnósticas avanzadas.
Guía ilustrada de Hongos comestibles de Santa Elena, Antioquia
(Universidad CES, 2025-06-19) Aboultaif Vargas, Valeria; Zapata Ocampo, Paola Andrea
Santa Elena, Antioquia, es el corregimiento rural más grande de Medellín. Su ecosistema montano bajo y muy húmedo montano bajo, con bosques de pineras naturalizadas, lo hace ideal para la funga y es frecuentemente visitado por aficionados a la naturaleza. Sin embargo, escasean las guías para la identificación de hongos locales y como cada vez hay más interés en los hongos, es fundamental tener herramientas que permitan a la comunidad a aprender de forma segura, previniendo malas identificaciones y evitando intoxicaciones. El objetivo de esta investigación es crear una guía ilustrada de Hongos comestibles, que unifique y complemente la información existente sobre la funga del corregimiento, que sea divulgativa y apta para el público general. Para ello, se revisaron colecciones del Herbario de la Universidad de Antioquia y se realizaron colectas en campo; también, con el fin de complementar la información, se realizaron análisis bromatológicos para seis especies, y se revisaron otros artículos para obtener tablas nutricionales adicionales. Con esto, se realizaron las 21 fichas presentes en la guía, acompañadas de ilustraciones detalladas que facilitan la identificación de dichos hongos. Se espera que esta guía fomente la identificación segura de hongos comestibles en Santa Elena, genere conciencia sobre el consumo responsable y contribuya a la valorización del patrimonio fúngico en la región.
Bioinformatic identification of the CRISPR-Cas system within the genus Leptospira
(Universidad CES, 2025-06-10) González Restrepo, Juanita; Peláez Sánchez, Ronald Guillermo; Asesor
Background/Objectives: In this study, the objective is to identify, through a bioinformatics analysis of their genomes, the type of CRISPR-Cas system and its component elements in the 69 reference Leptospira species Methods: Three online bioinformatic tools were used for this: CRISPRcasFinder, RAST, and PHASTEST. Results: The results show that 20 Leptospira species contain phage sequences, primarily within clades P1 and P2. Most of the identified CRISPR-Cas systems belong to Class I, mainly subtype I-E. Conclusions: This study concludes that due to the presence of cas genes, spacers, and their diversity support the active functionality of the CRISPR-Cas system in at least 20 Leptospira species.
Recolecta, aislamiento y cultivo de hongos marinos del Caribe colombiano
(Universidad CES, 2025-06-06) Vélez Moreno, Isabel; Coautor; Coautor
Este estudio tuvo como objetivo recolectar, aislar y cultivar hongos marinos asociados a dos matrices: Rhizophora mangle (mangle rojo) y Thalassia testudinum (pasto marino). Las muestras fueron recolectadas en el Golfo de Morrosquillo, en el manglar La Boquilla y los pastos marinos aledaños a la Reserva Natural Sanguaré, empleando técnicas de campo y laboratorio para la obtención de cepas fúngicas. Se obtuvieron 18 cepas pertenecientes al phylum Ascomycota, distribuidas en cinco géneros: Aspergillus, Penicillium, Pestalotiopsis, Emericella y Acremoium. El género con mayor frecuencia fue Aspergillus, con 13 aislamientos. La mayor cantidad de cepas fueron aisladas de Rizophora mangle, especialmente de la zona submareal de la raíz. Los resultados de este estudio contribuyen al conocimiento de la diversidad fúngica marina en Colombia, al igual de resaltar la necesidad de fortalecer la investigación en este campo inexplorado para el país.
Gestión y divulgación de la biodiversidad colombiana mediante datos abiertos: Experiencia práctica en Fundación Grupo Argos
(Universidad CES, 2025-06-05) Castro Marin, Sara; Asesor
En esta práctica se abordó la problemática relacionada con la gestión y divulgación de información sobre la biodiversidad colombiana, considerando la importancia del acceso abierto para la conservación efectiva de especies. Utilizando técnicas de curaduría digital, análisis estadístico básico y manejo de datos con herramientas especializadas, se validó, organizó y publicó 5.681 registros biológicos en el Sistema de Información Biológica de Colombia (SiB). Se identificaron 25 especies mediante el uso de cámaras trampa y plataformas digitales especializadas como eBird, Mammal Species of the World etc. Destacando la presencia de 16 aves, 8 mamíferos y 1 reptil. Además, la participación en actividades comunitarias como el monitore en Támesis, Antioquia, exposiciones educativas sobre biodiversidad y la evaluación del concurso de fotografía Huella Viva, fortalecieron la importancia de integrar la perspectiva comunitaria en las acciones de conservación. Los resultados de este trabajo evidencian cómo la publicación de datos abiertos puede fundamentar acciones concretas para la conservación, destacando la relevancia de la precisión taxonómica y el involucramiento activo de las comunidades locales. Este enfoque integral permite fortalecer la toma de decisiones y promover una gestión ambiental más participativa y eficaz.
Pasantía en laboratorio LIME: procesos de diagnóstico celular y molecular para leucemias
(Universidad CES, 2025-05-30) Escudero Pineda, Paulina; Juliana María; Asesor
La leucemia es una de las enfermedades de mayor interés médico en Colombia debido a su agresividad y la gran incidencia en la población pediátrica. El Laboratorio Integrado de Medicina Especializada (LIME) junto grupo de genética Medica y su semillero de Genética Médica de la Universidad de Antioquia se han dedicado al estudio y la atención de gran parte de estos casos en la ciudad de Medellín. Fue en esta institución en alianza con el semillero que se realizó una pasantía en las áreas de hematología, citometría de flujo, cultivo celular y citogenética donde se aplicaron los procedimientos para diagnosticar las leucemias entendiendo su morfología, mutaciones y antígenos que pueden presentarse, cómo estos afectan al diagnóstico, junto con el estudio de cómo se ha avanzado en la terapia de células CAR-T para la leucemia linfoide aguda.
Contribución a la gestión ambiental de ISAGEN mediante planes e indicadores de biodiversidad
(Universidad CES, 2025-06-04) Garro Parra, Salomé; Garro Parra, Salomé; Asesor; Asesor
La presente pasantía se desarrolló en ISAGEN S.A. E.S.P., empresa generadora de energía que integra criterios de sostenibilidad ambiental en su operación. El objetivo principal fue apoyar los procesos de gestión de biodiversidad mediante la formulación de Planes de Gestión de la Biodiversidad (PGB), la actualización de indicadores ecológicos y la participación en actividades complementarias del equipo ambiental. Durante el periodo de prácticas se formularon 16 PGB para centrales de generación en operación, siguiendo los lineamientos de la casa matriz Brookfield. Estos planes incluyeron evaluaciones de impacto, aplicación de la jerarquía de mitigación, estrategias de conservación, cronogramas de implementación y mecanismos de seguimiento adaptativo. Paralelamente, se llevó a cabo la actualización de los informes trimestrales de biodiversidad, en los cuales se registraron especies de flora previamente no documentadas por la empresa en las centrales correspondientes. Además, se propusieron mejoras en la estructura, claridad y trazabilidad de los datos contenidos en dichos informes. También se participó en el proceso de publicación de datos en el Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SiB), mediante el uso del formato Darwin Core y herramientas de validación taxonómica. Además, se colaboró en jornadas ambientales, visitas de seguimiento a proyectos de conservación en campo y espacios de articulación interinstitucional. Esta experiencia permitió comprender el rol del biólogo en escenarios productivos y evidenció la importancia de integrar ciencia, legislación y territorio para una gestión ambiental efectiva y sostenible en el sector energético.
Bacillus resistentes a la radiación: una clave para entender la búsqueda de bacterias en Marte
(Universidad CES, 2025-06-04) Álvarez Berrío, Eliana; Asesor; Asesor; Colaborador
La radiación es un factor crítico en la configuración de la habitabilidad planetaria, particularmente en Marte, donde la atmósfera delgada expone la superficie a altos niveles de radiación ultravioleta e ionizante. Este estudio explora los mecanismos adaptativos de especies del género Bacillus conocidas por su resiliencia en ambientes extremos, con el objetivo de evaluar su potencial como modelos de vida microbiana en condiciones marcianas. Se realizó un análisis filogenético de ocho genes clave relacionados con la reparación del ADN, la respuesta al estrés oxidativo y la adaptación térmica (recA, uvrA, uvrB, uvrC, katE, sodA, DnaK y groEL), utilizando secuencias simuladas de diez especies de Bacillus para validar el enfoque metodológico. Paralelamente, se llevó a cabo un análisis geoespacial para identificar ambientes terrestres análogos —como el Desierto de Atacama, la Antártida y lagos hipersalinos— donde se ha documentado la presencia de estas bacterias. Los parámetros ambientales de estos análogos fueron comparados con datos del Mars Climate Database y de la topografía derivada del MOLA para localizar regiones marcianas con condiciones similares. Los resultados muestran una consistencia filogenética con la distribución ecológica, lo que refuerza el uso de herramientas genómicas y geoespaciales integradas en astrobiología. Este enfoque multidisciplinario proporciona información sobre el potencial de supervivencia de microbios formadores de esporas en ambientes marcianos y destaca al género Bacillus como un modelo para comprender la resiliencia microbiana más allá de la Tierra.
Análisis de STRs para identificación de relaciones parentales en el laboratorio Genes SAS
(Universidad CES, 2025-06-03) González David, Emily; Asesor; Asesor
El presente informe describe la experiencia adquirida durante la pasantía realizada en el laboratorio Genes SAS, enfocada en el análisis de ADN para la investigación de relaciones parentales. Durante el desarrollo de la práctica, se llevaron a cabo procesos de extracción de ADN mediante la técnica Chelex-100, la amplificación por PCR utilizando el estuche comercial VeriFiler Express y el análisis de fragmentos de ADN a través de electroforesis capilar en el analizador genético ABI 3500. Asi mismo, se fortalecieron habilidades en la interpretación de electroferogramas utilizando el software GeneMapper, con especial énfasis en la identificación de artefactos y mezclas genéticas. Se adquirió experiencia en la aplicación de Buenas Prácticas de Laboratorio (BPL), la implementación de controles de calidad internos y la comprensión de normativas internacionales como ISO/IEC 17043 e ISO/IEC 17025. Este trabajo resalta la importancia de la estandarización de procedimientos y el análisis riguroso para la obtención de perfiles genéticos confiables en genética forense.
Aplicación de múltiples enfoques bioinformáticos en la identificación de aptámeros a partir de datos NGS post-SELEX para el diagnóstico de enfermedades tropicales: pasantía Baltymas lab (ICMT-CES)
(Universidad CES, 2025-05-28) Zapata Olarte, Elizabeth; Asesor
El trabajo de grado en modalidad pasantía en Baltymas Lab ICMT se enfocó en el fortalecimiento de competencias en biología molecular y análisis bioinformático, así como en la participación activa en proyectos de investigación relacionados con el desarrollo de aptámeros de ADN con aplicaciones en salud humana. Durante la pasantía, se llevaron a cabo diversas actividades experimentales, entre ellas PCR, electroforesis, y depleción de albúmina e inmunoglobulina G en muestras biológicas. También se participó en la síntesis de nanopartículas magnéticas. Posteriormente, se realizó análisis bioinformático aplicado a datos de secuenciación masiva (NGS), obtenidos a partir de SELEX. El análisis se centró en tres conjuntos de datos: Alondra, CH y SX. En el conjunto Alondra, se diseñó un aptámero sintético. En el conjunto CH, se identificaron variantes del aptámero CH1 capaces de interactuar con una región alterna de la subunidad alfa de la ATPasa de Trypanosoma cruzi. Por otro lado, el conjunto SX presentó limitaciones en el enriquecimiento de secuencias, por lo cual se recomendó repetir el protocolo SELEX bajo condiciones más estrictas. Además del trabajo técnico, se participó en clubes de revista, promoviendo la discusión científica y el fortalecimiento del pensamiento analítico. Esta pasantía representó un espacio formativo integral, en el que se integraron habilidades prácticas, teóricas y computacionales en un entorno real de investigación, contribuyendo tanto al avance de los proyectos del laboratorio como al desarrollo académico y profesional.
Pasantía en el grupo de investigación Biología y Control de Enfermedades Infecciosas (BCEI)
(Universidad CES, 2025-03-06) Mera Estrada, Dahiana; Asesor
Se realizó una pasantía durante 4 meses en el grupo de investigación Biología y Control de Enfermedades Infecciosas (BCEI) de la Universidad de Antioquia, el cual brinda una oportunidad para el desarrollo de un perfil profesional enfocado en la investigación, permitiendo aplicar, fortalecer y aprender conocimientos teóricos y habilidades prácticas de un estudiante de pregrado en Biología. Durante la pasantía se adquirieron habilidades prácticas en el campo de la bioinformática; se llevó a cabo un análisis de regulación postranscripcional de microARN en cardiomiocitos humanos chagásicos, logrando identificar 11 microARN diferencialmente expresos que posiblemente tengan un efecto en la regulación de algunos genes. También se desarrollaron habilidades en técnicas moleculares para el proceso de clonación de un plásmido para la sobreexpresión de un gen en Trypanosoma cruzi, implementando técnicas como PCR, electroforesis, ligación, transfección, entre otros. Finalmente, se lograron cumplir los objetivos planteados, enriqueciendo el perfil profesional y así tener bases y conceptos para la investigación en el área de la bioinformática

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