dc.contributor	Agudelo Flórez, Piedad Matilde
dc.contributor.author	Ramírez García, Francisco René
dc.date.accessioned	2020-11-27T17:46:03Z
dc.date.available	2020-11-27T17:46:03Z
dc.date.issued	2020-11-26
dc.identifier.citation	ramirez-garcia rene	spa
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10946/5038
dc.description.abstract	La leptospirosis es una zoonosis identificada como un problema de salud pública en países tropicales que afecta a poblaciones tanto de áreas urbanas como rurales. La enfermedad es causada por espiroquetas del género Leptospira que es endémica en la región de Urabá, Colombia, donde se favorece su transmisión a través de fuentes de agua que permiten la permanencia de la espiroqueta que a su vez circula en una diversidad de hospederos animales y en humanos expuestos. Es reconocido que hay un vínculo entre serovariedades de Leptospira spp y sus hospederos, pero hasta el presente en Urabá no se dispone de información sobre genotipificación de las especies y serovares de la bacteria que circulan en esta región que establezcan vínculos entre los actores del ciclo de la bacteria en ambiente (aguas-suelos), hospederos crónicos, susceptibles y reservorios. Lo anterior no ha permitido la identificación completa de potenciales fuentes de infección bacteriana para los actores susceptibles del ciclo principalmente los humanos. El conocimiento anterior es necesario para establecer programas de diagnóstico y control de la enfermedad respaldados en evidencia del vínculo entre hospedero y serovariedad basados en estudios de genotipificación y específicos para la zona de Urabá. Este estudio tuvo como objetivo describir la diversidad genética de los patrones genómicos (genomoespecies, seroptipos y serovariedades) de Leptospira spp circulantes en muestras de hospederos susceptibles (humanos), hospederos sinantrópicos y muestras ambientales (agua). La infección por las especies del género Leptospira fue detectada por secuenciamiento directo de productos obtenidos de la amplificación tanto por PCR convencional como por PCR en tiempo real mediante del gen rrs 16S rRNA en muestras de sangre(n: 280) y orina (n: 256) de humanos con síndrome febril agudo, tejidos de riñón de hospederos sinantrópicos (n: 141) y muestras de agua domiciliarias (n: 238). Se evaluaron tres esquemas de MLST B2013, 7RL y L3 basado en la amplificación de los genes glmU, pntA, pfkB, mreA, sucA, tpiA, caiB, LipL32, LipL41, adk, icdA, secY. Los análisis moleculares revelaron una frecuencia de infección por Leptospira spp de 12,5% (35/280) en sangre de humanos, 10,93% (28/256) en orina humana, 9,21% (13/141) en hospederos sinantrópicos y 7,14% (17/238) en aguas. Fueron identificadas cinco especies de Leptospira spp patógenas: L. interrogans, L santarosai, L borgpetersenii, L. noguchii y L. kirschneri y 10 diferentes genotipos (ST). La caracterización molecular determinó que los genes rrs, LipL41, LipL32 y mreA fueron los más sensibles para la tipificación de las muestras biológicas. En humanos SFA con leptospiremia fue hallada L. interrogans ST 78 (serogrupo Icterohaemorrhagiae, serovar Copenhageni), L. santarosai ST 220 (serogrupo Shermani, serovar Shermani) y ST 258 (serogrupo Grippotyphosa, serovar Bananal). En humanos SFA con leptospiruria fue hallada L. interrogans ST 6 (serogrupo Icterohaemorrhagiae, serovar Copenhageni). En roedores relacionados epidemiologicamente con los humanos enfermos fue hallada L. interrogans ST 6, ST 122 (serogrupo Icterohaemorrhagiae serovar Copenhageni) ST 236 (serogrupo Icterohaemorrhagiae serovar Lai) y ST 19 (serogrupo Autumnalis, serovar Carlos). En murcielagos fue hallada L. interrogans ST 19 (serogrupo Autumnalis, serovar Carlos) y L. kirschnerii ST 123 (serogrupo Hebdomadis, serovar Kambale), ST 99 (serogrupo Autumnalis, serovar Bulgarica), L. noguchii ST 83 (serogrupo Louisiana, serovar Louisiana) y L. interrogans ST 6 (serogrupo Icterohaemorrhagiae, serovar Copenhageni). El genotipo dominante en humanos y en ratas fue ST6, en murcielagos los genotipos fueron ST 19, ST 123, ST 99. La especie identificada en agua fue L. santarosai pero no se logró tipificar con MLST hasta el nivel de serovariedad. Los resultados del presente estudio demuestran que todos los genotipos –ST- hallados con MLST en humanos, roedores y murciélagos son de Leptospira patógenas asociados a formas de la enfermedad de curso moderado a severo las cuales deben ser tenidas en cuenta, por parte de las autoridades de vigilancia en salud pública, para ser introducidas en el panel de diagnóstico serológico de la enfermedad. Por su parte, el personal clínico debe considerar a Leptospira como un agente causal de síndrome febril agudo severo en casos humanos que se presenten en la zona de Urabá. La información de la circulación de especies en hospederos emergentes como lo son los murciélagos, debe ser tenida en cuenta para hacer los ajustes correspondientes en la redefinición de las estrategias de intervención epidemiológicas clásicas que establecen estrategias de intervención dirigidas a control de reservorios clásicos (roedores), pero que deben proyectarse al control de nuevos actores intervinientes en el ciclo específico de la enfermedad en la zona. Esta investigación sienta las bases por primera vez para Colombia de cómo, las herramientas de genotipificación aunados a los análisis filogeográficos, son útiles para evidenciar hasta el nivel de serotipo los hospederos susceptibles, sinantrópicos y ambientales de Leptospira spp que circulan en una zona endémica determinada. La información evidencia genómicamente los perfiles de transmisión de esta espiroqueta en las fuentes de exposición ambiental y de hospederos, que perpetúan el ciclo de la enfermedad en esta zona de alta incidencia y prevalencia de leptospirosis como lo es el Urabá Antioqueño.	spa
dc.description.sponsorship	Proyecto INV032016006 Dinámica de circulación de patrones moleculares de Leptospira spp en la región de Urabá, departamento de Antioquia, Colombia. Financiado por la Universidad CES.	spa
dc.language.iso	es	spa
dc.publisher	Universidad CES	spa
dc.subject	infección	spa
dc.subject	fiebre	spa
dc.subject	genómica	spa
dc.subject	Leptospirosis	spa
dc.title	Dinámica de circulación de patrones genómicos de Leptospira spp en la región de Urabá, Departamento de Antioquia Colombia.	spa
dc.type	Trabajo de Grado	spa
dc.rights.license	Restringido	spa
dc.educationLevel	tesis de doctorado	spa
dc.contributor.role	Asesor	spa

Dinámica de circulación de patrones genómicos de Leptospira spp en la región de Urabá, Departamento de Antioquia Colombia.

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