Resumen

Introducción: La enfermedad de Chagas, causada por el parásito Trypanosoma cruzi, es endémica en América Latina y se presenta en dos fases: aguda y crónica. La fase crónica es de complejo diagnóstico, por lo que se busca encontrar nuevos biomarcadores que mejoren su detección. Los aptámeros, son moléculas de ADN o ARN con alta afinidad y especificidad hacia moléculas objetivo. Gracias a su versatilidad y capacidad de reconocimiento, se perfilan como una prometedora opción para la búsqueda de nuevos biomarcadores y potencial uso en el diagnóstico de la enfermedad de Chagas. Objetivo: Identificar biomarcadores potencialmente útiles para el diagnóstico de la enfermedad de Chagas en fase crónica utilizando la estrategia Bio-SELEX. Metodología: Este estudio fue observacional que involucró 4 grupos, cada uno con 18 muestras de suero. Se extrajeron proteínas de estas muestras para llevar a cabo una estrategia modificada de SELEX, denominada Bio-SELEX. Luego, se aislaron e identificaron las proteínas reconocidas por medio de Pull-Down y LC-MS/MS. Finalmente se hicieron experimentos de Docking molecular para conocer la interacción aptámero-proteína. Resultados: Tras realizar el proceso de Bio-SELEX, se obtuvieron por NGS 204,132 secuencias de potenciales aptámeros, de las cuales se seleccionaron las cinco más representativas, denominando a la primera como CH1. Se aislaron bandas en dos grupos de muestras (extractos de proteínas y en sueros totales de pacientes con EC) por Pull-Down y entre las proteínas identificadas por LC-MS/MS, se destacó la subunidad alfa de ATPasa de T. cruzi como potencial biomarcador. Se realizó Docking molecular entre el aptámero CH1 y la proteína, identificando aminoácidos y nucleótidos críticos involucrados en la interacción. Discusión: La subunidad alfa de ATPasa fue la única detectada en ambos grupos (extractos de proteínas y sueros individuales). Las ATPasas son esenciales para la supervivencia y virulencia del parásito, lo que las convierte en posibles objetivos diagnósticos y terapéuticos. El enfoque Bio-SELEX permitió la identificación directa de la subunidad alfa de ATPasa de T. cruzi pero se necesita más investigación para su completa caracterización y comprender su función en el metabolismo celular del parásito. Conclusión: La identificación directa de la subunidad alfa de la ATPasa mediante el aptámero CH1 por Bio-SELEX abre potenciales usos diagnósticos, pero se necesita más investigación para su completa caracterización y el diseño de posibles herramientas diagnósticas.