Identificación de agentes bacterianos mediante mNGS en neonatos prematuros con factores de riesgo para sepsis neonatal temprana nacidos en el Hospital Meissen de Bogotá
Resumen
Antecedentes. La prevalencia de sospecha de sepsis neonatal de inicio precoz en neonatos prematuros está muy extendida en las unidades neonatales, constituyendo la principal razón para la administración de antibióticos tras su ingreso en la unidad. Llegar a un diagnóstico concluyente presenta retos que se derivan principalmente de las limitaciones asociadas a los métodos diagnósticos empleados actualmente. El objetivo de este estudio fue evaluar la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) dirigida al gen ribosómico 16S (ADNr 16S) y la secuenciación de Sanger para la identificación bacteriana en neonatos prematuros con sospecha de sepsis neonatal de inicio precoz. Métodos. Se realizó un estudio prospectivo. Se incluyeron neonatos prematuros con sospecha de sepsis neonatal de aparición temprana. Se tomaron muestras de sangre al ingreso en la unidad neonatal. Además, se recogieron variables clínicas y de laboratorio en las primeras 72 horas de vida, y se realizó la amplificación por PCR y posterior secuenciación Sanger de la región V3 del ADNr 16S en busca de bacterias causantes de sepsis neonatal precoz. Resultados. Se incluyeron 28 pacientes. Se formaron tres grupos según los criterios clínicos y el riesgo de infección. Los hemocultivos fueron negativos en el 100% de los pacientes. La amplificación y secuenciación de la región V3 identificó distintos géneros bacterianos en 28 pacientes de distintos grupos. La identificación taxonómica predominante fue el género Pseudomonas. Conclusiones. La amplificación de la región variable del ADNr 16S mediante PCR y las subsiguientes tecnologías de secuenciación de Sanger en neonatos prematuros con sospecha de sepsis neonatal de inicio precoz puede mejorar la identificación de las especies microbianas causantes de la infección. Resulta especialmente eficaz para identificar especies asociadas a microorganismos difíciles de cultivar.Impacto
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