Metodología para el ensamblaje de los reads obtenidos por secuenciación de nueva generación (NGS) en la plataforma Ilumina HiSeq 2500 del genoma completo del pasto Kikuyo (Pennisetum clandestinum Hochst. Ex. Chiov)
Date
2016
Authors
Gamarra Rueda, Ramón
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Publisher
Universidad CES
Abstract
El objetivo de este estudio fue describir una metodología para ensamblaje de los reads de esos genes (Nrt1.1, Nrt2.1, Nrt1.2 y Amt1) a partir del secuenciamiento total del genoma del pasto Kikuyo. A partir de muestras de la planta Kikuyo se realizó la extracción de ADN con una relación 260/280 de 2,17 y alta calidad del material extraído. GenomaCES realizó el secuenciamiento de nueva generación usando la plataforma Ilumina Hiseq 2500 y se diseñaron dos librerías con tamaños de 230 pb y 450 pb.
Description
Keywords
Medicina veterinaria y zootecnia, Forraje, Nitrógeno, Plantas, Secuenciación