Comparación genómica de Salmonella Typhimurium variante monofásica de origen humano, porcino y de canales de una planta de beneficio, 2020 -2021

Abstract

La salmonelosis es una infección de origen zoonótico que puede transmitirse a los humanos por el consumo de aguas y alimentos contaminados. Los derivados cárnicos de origen porcino son una de las principales fuentes de infección, lo cual representa un riesgo para la salud humana y el sector porcícola. Convencionalmente se han usado técnicas moleculares, cultivo y serología como herramientas para el reporte epidemiológico e identificación de Salmonella spp. En los últimos años ha cobrado relevancia la aplicación de la secuenciación del genoma completo para el rastreo de brotes, la atribución de fuentes y la evaluación de riesgos de patógenos transmitidos por alimentos y otras zoonosis. En Colombia, la exploración de la genética de Salmonella spp. sigue siendo un campo poco estudiado y no hay información suficiente sobre las diferencias o similitudes de acuerdo con el origen de este patógeno. Objetivo: Comparar las secuencias genómicas de los aislamientos de Salmonella Typhimurium variante monofásica de origen porcino y humano. Materiales y métodos: Se recuperaron aislamientos de Salmonella spp. de fuente humana, porcina y de canales provenientes de los municipios de Medellín, Santa Rosa de Osos, La Pintada y Don Matías. Se realizó una predicción del serotipo por PCR-M y los aislamientos positivos para la variante monofásica de S. Typhimurium se les realizó secuenciación del genoma completo. Los genes de virulencia, resistencia, plásmidos, islas de patogenicidad fueron analizados por bioinformática. Resultados: Se caracterizaron 7 genomas de S. Typhimurium monofásica (1,4,[5],12:i:-) circulantes en Medellín, La Pintada y Don Matías. Se realizó la predicción de los factores de virulencia, genes de resistencia, plásmidos de relevancia e islas de patogenicidad para cada aislamiento. Además, se analizaron las proteínas únicas para los aislamientos provenientes de humanos, porcinos y de canal.